南昌航院附属学校创办于1955年，当时只有初级小学复式教学班1个，学生十余人，教师2人，第一任负责人为汪慧观。此后几年中，教学规模逐渐扩大，师生人数逐渐增多。1960年起，增设初中班。1972年9月创办高中，其后20多年中，高中办办停停，并一度由普通高中改为职业高中，1995年9月，恢复办普通高中至今。

　　近半个世纪以来，经过附校几代师生员工的辛勤努力，学校经历了一个办学规模逐步扩大、师资力量逐步增强、办学条件逐步改善、教学质量逐步提高的发展过程。学校名称也几经改变，由初创时的“子弟小学”，到包括小学、中学部的“子弟学校”，文革时改名为“五七学校”，文革后又恢复为“子弟学校”，1984年改为“附属学校”。

　　 学校实行校长负责制，现任校领导为：袁 敏 校长兼书记；王长华 副校长兼副书记；王治中 副校长；何钱红 副校长。